उप-मुख्यमंत्री पद की शपथ लेने के बाद NCP के बागी गुट ने घोषणा की है कि अजित पवार को सर्वसम्मति से पार्टी के विधायक दल का नेता चुन लिया गया है। प्रफुल्ल पटेल ने कहा कि वो शरद पवार से हाथ जोड़ कर विनती करते हैं कि वो आशीर्वाद दें, क्योंकि वो हमारे गुरु हैं। उधर शपथग्रहण समारोह में मौजूद रहे सांसद अमोल कोल्हे अब खुद को शरद पवार के साथ बता रहे हैं। 8 नए मंत्रियों के अलावा 15 अन्य विधायकों ने अजित पवार का समर्थन किया है, जबकि चाचा शरद पवार के साथ 14 विधायक हैं। कई अभी चुप हैं।
NCP के बागी नेता प्रफुल्ल पटेल ने घोषणा की है कि विधायक अनिल भाईदास पाटिल को महाराष्ट्र विधानसभा में पार्टी का चीफ व्हिप बनाया गया है। उधर शरद पवार ने ट्वीट कर के प्रफुल्ल पटेल और सुनील तटकरे को NCP की प्राथमिक सदस्यता से निलंबित करने का आदेश दिया है। उन्होंने कहा कि NCP के राष्ट्रीय अध्यक्ष के रूप में ये आदेश दे रहे हैं। उन्होंने कहा कि पटेल और तटकरे को पार्टी विरोधी गतिविधियों के कारण पार्टी की प्राथमिक सदस्यता से निलंबित किया जाता है।
वहीं NCP के बागी नेताओं ने सुनील तटकरे को पार्टी का प्रदेश अध्यक्ष घोषित कर दिया है। शरद पवार के खेमे के हिसाब से जयंत पाटिल अभी भी पार्टी के प्रदेश अध्यक्ष हैं। जबकि प्रफुल्ल पटेल ने कहा कि उन्होंने जयंत पाटिल को आधिकारिक रूप से उन्हें हटाए जाने के बारे में बता दिया है और आगे बाकी नियुक्तियाँ सुनील तटकरे ही करेंगे। उधर बिहार में राजद सुप्रीमो ने इस बगावत पर कहा कि शरद पवार एक हैसियत हैं, ताकत हैं, उन पर कोई असर नहीं पड़ेगा।
उन्होंने दावा किया कि इस ताकत को प्रधानमंत्री नरेंद्र मोदी ने हिलाने की कोशिश की, लेकिन सब विफल हो गए। उधर शरद पवार ने 9 विधायकों को अयोग्य घोषित करने के लिए विधानसभा अध्यक्ष और चुनाव आयोग को पत्र लिखा है। वो विधायक हैं – अजित अनंतराव पवार, छगन चंद्रकांत भुजबल, दिलीप दत्तात्रेय वालसे पाटिल, हसन मियालाल मुश्रीफ, धनंजय पंडितराव मुंडे, धर्मरावबाबा भगवंतराव अत्राम, अदिति सुनील तटकरे, संजय बाबूराव बनसोडे और अनिल भाईदास पाटिल।
NCP के शरद पवार धड़े ने प्रदेश सचिव शिवाजीराव गर्जे, अकोला जिला के जिलाध्यक्ष विजय देशमुख और मुंबई कार्य अध्यक्ष नरेंद्र रणे को भी पार्टी से निकाले जाने की घोषणा की है। अब तक अजित पवार के साथ रहे अमोल कोल्हे वापस शरद पवार के पास लौट आए हैं। इस पर पूर्व मंत्री जितेंद्र अव्हाड ने कहा कि कुछ लोगों को गुमराह किया गया और शपथग्रहण के बारे में नहीं बताया गया। उधर NCP के छात्र संगठन की अध्यक्ष सोनिया दूहन ने दिल्ली स्थित कार्यालय से प्रफुल्ल पटेल की तस्वीर हटा दी।
भाजपा नेता देवेंद्र फडणवीस से भी अजित पवार, सुनील तटकरे, प्रफुल्ल पटेल और छगन भुजबल ने मुलाकात की। अजित पवार गुट ने NCP नेता उमेश पाटिल ने कहा कि शरद पवार हमारे लिए भगवान के समान हैं, वहीं प्रफुल्ल पटेल ने भी उन्हें सम्माननीय बताया। उमेश पाटिल ने कहा कि 5 जुलाई को नेता जिसकी बैठक में आएँगे, उससे सब तय हो जाएगा। उस दिन शरद और अजित, दोनों ने बैठक बुलाई है। शरद पवार ने कहा है कि ये महत्वपूर्ण नहीं है कि किसके पास कितना समर्थन है, संगठन ज्यादा ज़रूरी है।